CAN Minutes

Author

Laurent Gilquin

Published

September 16, 2025

Présents: Carine Rey (CIRI), Laurent Modolo (LBMC), Laurent Gilquin (IGFL), Ghislain Durif (LBMC), Jérémy Just (RDP), Cécile Hilpert (MMSB), Evelyne Duvernois (RDP), Jacques Brocard (SFR), Vincent Bayle (RDP)

Excusés: Jocelyn Turpin (IVPC), Lucie Etienne (CIRI), Estelle Devêvre (SFR), Sergio Sarnataro (IGFL), Ema Caracas (SFR)

Organisation des formations d’automne

Lancement des inscriptions aux formations, gestion de chaque formation par responsable :

  • choix des créneaux indépendant pour chaque formation
  • diffusion du mail d’inscription via la mailing list SFRBiosciences puis au sein des laboratoires par les représentants du CAN avec un rappel après 1 semaine
  • indiquer dans le titre du mail d’inscription la gratuité de la formation ainsi que le nombre de places disponibles
  • rappeler aux encadrants de ne pas hésiter à inscrire leurs futurs Phd même si ils n’ont pas encore de compte ENS

Formation R

responsable: Ghislain Durif

1 groupe encadré par 3 formateur(trice)s le jeudi de 13h à 14h30.
16 séances, à raison d’une séance par semaine, réservées dans la salle CBP M7 1H04 (28 places).
Démarrage début octobre.

Formation Unix

responsable: Jérémy Just

1 groupe encadré par 4 formateur(trice)s, créneau à définir.
(12?) séances, à raison d’une séance par semaine, réservées dans la salle de formation IGFL (12 places).
Démarrage début novembre.

N.B : faire une demande d’accès au bâtiment IGFL pour les formateurs

Formation Python

responsable: Laurent Gilquin

3 groupes encadrés chacun par 3 formateur(trice)s : - lundi de 14h à 15h30 - jeudi de 10h à 11h30 - jeudi de 14h à 15h30 12 séances, à raison d’une séance par semaine, réservées dans la salle de formation IGFL (12 places).
Démarrage début novembre.

N.B : faire une demande d’accès au bâtiment IGFL pour les formateurs

Formation Git

responsable: Laurent Modolo

1 groupe, nombre de formateur(s) à définir.
1 séance d’une demi-journée, lieu à définir.
Démarrage octobre-novembre.

Formation Nextflow

responsable: Nicolas Fontrodona (LBMC)

1 groupe, nombre de formateur(s) à définir.
3 séances d’une demi-journée, lieu à définir.
Démarrage octobre-novembre.

Prérequis : connaitre les bases de la formation Unix
Support de TP : GitHub-collab
Programme : les bases de Nextflow, créer sa propre pipeline, couplage nf-core

Formation FIDDLE

responsables: Laurent Modolo, Ghislain Durif

1 groupe encadré par 2 formateurs.
séances hebdomadaires dans la salle CBP M7 1H04 (28 places).
Démarrage en octobre.

Prérequis : avoir son ordinateur portable et des connaissances de base en Python
N.B : vidéos en français

Formation RNASeq

responsable: Carine Rey

1 groupe encadré par 2 formateurs le jeudi après-midi (heures à définir).
12 séances, à raison de 2 séances par semaine, réservées dans la salle de formation de l’ENS (24 places).
Démarrage début février.

Autres informations

Des personnes du LBMC vont participer à une formation organisée Septembre-Octobre sur 4 séances portant sur la reproductibilité avec les langages R et Python.

Proposition Laurent M. pour l’année prochaine : ouvrir une formation reproductibilité au sein du CAN en s’inspirant du contenu de celle de l’IARC si les retours des participants sont positifs.

Réflexion sur la mutualisation de ressources GPU

Ghislain soumet une proposition de construire un groupe de réflexion sur la mutualisation de ressources GPU + serveurs.
Un des objectifs pourrait être de mettre à disposition de l’ensemble des labos de Bio de l’ENS un agent conversationnel auto-hébergé.

→ quelle contribution de chaque labo? à quelle hauteur?
→ attention au chevauchement avec le “Schéma Directeur du Numérique”

Prochaine réunion

Janvier 2026